Перемещаем загрузчик с одного диска на другой, а точнее создаем новый загрузчик, после установки Windows на внешний Thunderbolt диск.
Как установить Windows на внешний Thunderbolt диск описано в статье Установка Windows на Thunderbolt диск.
После установки Windows на Thunderbolt диск появляется один небольшой недочет. Загрузчик находится на основном диске, а сама система на внешнем диске. Займемся устранением данного недочета.
Еще раз загрузимся с загрузочной флешки, но систему ставить не будем, а вызовем консоль командой Shift+F10.
Запустим утилиту diskpart:
diskpart
Выведем список дисков в системе, чтобы определить какой номер диска соответствует внешнему диску:
list disk
Читать далее Добавление загрузочной области на GPT диск